領到臺灣居留證後，只要在居留證的效期內，港澳人士停留在臺灣的時間沒有限制，可自由出入境不須額外申請簽證。
除了不能領取臺灣居民補助、沒有投票權、沒有台灣護照、不能出任公職之外，其他待遇都跟台灣居民一樣，例如同樣擁有保健福利、可以考駕使執照、手機上台、貸款置業、做生意等等。

即使領到臺灣居留證，仍可同時持有外國身分證及護照，亦不會影響其功能及權益。

若日後想入籍臺灣，只要持有居留證並在臺灣居住滿一年，且出境不超過30天，即可向臺灣移民署申請定居證入籍臺灣，之後換拎臺灣身分證。

臺灣男性凡年滿18歲之翌年一月一日起需服兵役，至屆滿三十六歲之年十二月三十一日除役，臺灣男性皆有服兵役之義務，但持有臺灣居留證身份者無須服役。